[ABE-L] Fwd: Fw: Academic Seminar of Data Science with Gabriela Cybis of UFRGS - Hybrid

Qua Abr 5 12:21:25 -03 2023

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Link: https://zoom.us/j/95781336030

Dia: 06 de abril de 2023

Horário: 12h-13h15

*Title:* *Sparse precision matrix estimation in phenotypic trait evolution
models*

*Speaker:*  Gabriela Cybis <https://orcid.org/0000-0002-2791-6735>

*University:*  UFRGS <http://www.ufrgs.br/ufrgs/inicial>

*Abstract:*  Phylogenetic trait evolution models allow for the estimation
of evolutionary correlations between a set of traits observed in a sample
of related organisms. By directly modeling the evolution of the traits
along an estimable phylogenetic tree, the model's structure effectively
controls for shared evolutionary history. In these models, relevant
correlations are usually assessed through the high posterior density
interval of their marginal distributions. However, the selected
correlations alone may not provide the full picture regarding trait
relationships. Their association structure, expressed through a graph that
encodes partial correlations, can in contrast highlight sparsity patterns
featuring direct associations between traits. In order to develop a
model-based method to identify this association structure we explore the
use of Gaussian graphical models (GGM) for covariance selection. We model
the precision matrix with a G-Wishart conjugate prior, which results in
sparse precision estimates. Furthermore, the model naturally allows for
Bayes Factor tests of association between the traits, with no additional
computation required. We evaluate our approach through Monte Carlo
simulations and applications that examine the association structure and
evolutionary correlations of phenotypic traits in Darwin's finches and
genomic and phenotypic traits in prokaryotes. Our approach provides
accurate graph estimates and lower errors for the precision and correlation
parameter estimates, particularly for conditionally independent traits,
which are the target for sparsity in GGMs.

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April 6, 2023

[image: Ã cone Hora]

12pm de São Paulo, Brasil (UTC/GMT -03:00)

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Paulo Renato de Souza room, 2nd floor - Building 1

The seminar will be streamed at link <https://zoom.us/j/95781336030>

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Rua Quatá, 300 - Vila Olímpia - São Paulo/SP - Brasil - CEP: 04546-042 |
Tel: (11) 4504-2400

-- 
Hedibert Freitas Lopes, PhD
Professor of Statistics and Econometrics
INSPER - Institute of Education and Research
Rua Quatá, 300 - São Paulo, SP 04546-042 Brazil
Phone: +55 11 4504-2343
www.hedibert.org
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