[ABE-L] Seminários PIPGEs

[Michel H. Montoril]

Caros,
Dando continuidade ao ciclo de seminários conjunto UFSCar/ICMC-USP, gostaríamos de convidar a todos para o próximo evento, dia 19/03, às 14h. Seguem informações abaixo. Devido a problemas de invasões que têm ocorrido em alguns eventos online, o link do evento será divulgado apenas no dia.
Sintam-se à vontade para divulgar (arquivo em anexo) entre eventuais interessados.
Saudações,
Michel

Streaming:
Google Meet (link will be available on the day of the event at www.pipges.ufscar.br <http://www.pipges.ufscar.br/seminarios/26-03-2021-scalable-coalescent-inference-by-sampling-tajima2019s-trees-speaker-lorenzo-cappello>)

Title:
Scalable coalescent inference by sampling Tajima’s trees

Speaker:
Lorenzo Cappello (Stanford University)

Abstract:
The observed sequence variation at a locus informs about the evolutionary history of the sample and past population size dynamics. The standard Kingman coalescent model on genealogies – timed trees that represent the ancestry of the sample – is used in a genera- tive model of molecular sequence variation to infer evolutionary parameters. However, it is computationally challenging to use this inference when sample size grows. We will discuss a lower-resolution coalescent model, called Tajima heterochronous n-coalescent, as a computationally efficient alternative to the Kingman coalescent. We will study how to quantify the size of the underlying state space, compute the likelihood, employ it in a Bayesian nonparametric model, and use it in applications.



===============================
/* Michel H. Montoril, 
 * Assistant Professor,
 * Department of Statistics,
 * Federal University of São Carlos,
 * São Carlos, SP, 13565-905, Brazil
 */

-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://lists.ime.usp.br/pipermail/abe/attachments/20210317/dd5e8b4b/attachment-0002.htm>
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo não-texto foi limpo...
Nome: announcement-Cappello.pdf
Tipo: application/pdf
Tamanho: 68581 bytes
Descrição: não disponível
URL: <http://lists.ime.usp.br/pipermail/abe/attachments/20210317/dd5e8b4b/attachment-0001.pdf>
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://lists.ime.usp.br/pipermail/abe/attachments/20210317/dd5e8b4b/attachment-0003.htm>