[ABE-L] Seminário EMAp 09/09/2021

Ter Set 7 13:40:01 -03 2021

Caros redistas,

Nesta quinta-feira, a Escola de Matemática Aplicada da FGV receberá o Dr.
Jere Koskela, da Universidade de Warwick (Reino Unido) para falar sobre
MCMC no contexto de um problema envolvendo árvores filogenéticas. O
seminário ocorre às 16h, e o link encontra-se abaixo.

Esperamos vocês!

Cordialmente,

Luiz

[image: cid:image001.jpg em 01D56E0B.2914C3E0]

*GRADIENT-BASED, NONREVERSIBLE MCMC FOR COALESCENT TREES*

Posterior distributions arising out of coalescent-based models of genetic
diversity are nearly always intractable. Markov chain Monte Carlo methods,
typically based on the Metropolis-Hastings algorithm, are gold-standard
tools for sampling from these posteriors. However, their computational cost
scales notoriously badly with problem complexity, so that their practical
use is restricted to data sets which are small by modern standards. Over
the past 5 years, several classes of nonreversible MCMC methods which use
the gradient of the posterior density to guide chains during runs have
become increasingly prominent as competitors of Metropolis-Hastings. These
methods have better theoretical scaling properties than
Metropolis-Hastings, but cannot be readily implemented for coalescent
models because a posterior defined on discrete tree topologies does not
have a natural analogue of a gradient. I will demonstrate how embedding
spaces of coalescent trees into a continuous space facilitates the use of
gradient information in algorithm specification, and also provides a
framework for designing adaptive MCMC algorithms in a principled way. I
will also outline how the same approach can be generalised to other state
spaces involving boundaries, discrete variables, or disconnected regions.
Comparisons with Metropolis-Hastings on simple coalescent examples show
that these methods speed up mixing over the posterior, sometimes
dramatically.

Texto informado pelo autor.

*Quando e Onde:*

09 de Setembro de 2021, às *16h*

Via Zoom

Registre-se com antecedência para este seminário:

https://fgv-br.zoom.us/meeting/register/tJcsceyupjIjHtK9BmjGS2MH7CpndEK6GGZc
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Após o registro, você receberá um e-mail de confirmação contendo
informações sobre conexão no seminário.

*Palestrante:*

*Jere Koskela* - holds an MMORSE, a MSc and a PhD from the University of
Warwick (UK), where he is currently an Associate Professor at the
Department of Statistics. He was also a postdoctoral researcher  at
Institut für Mathematik, Technische Universität Berlin, Germany. His
research interests include Monte Carlo methods, statistical inference from
stochastic processes and in settings with intractable likelihood, Bayesian
nonparametric statistics, coalescent processes, and mathematical population
genetics.

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-- 
Luiz Max Fagundes de Carvalho
Lecturer, School of Applied Mathematics (EMAp), Getúlio Vargas Foundation
(FGV), Brazil.
Praia de Botafogo, 190, Sala 511, Rio de Janeiro, RJ 22250-900.
Brazil
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