[ABE-L] Simulating an epidemic

[Alexandre Galvão Patriota]

Abaixo veja a evolução do número de mortos por continente. Alguns tem me
perguntado como fiz para simular os dados:

Usei o modelo epidemiológico compartimental. A dinâmica ocorre por
compartimentos, a saber
Susceptíveis -> infectados -> {Mortos, Recuperados}

A dinâmica de entrada em e saída de cada compartimento são definidas por
meio das equações diferenciais. Para simular os dados basta definir as
probabilidades de passar de um compartimento para outro.

1. Gerei números aleatórios dentro de um cenário.
2. As partículas andam conforme um passeio aleatório dentro do cenário.
3. Todos são susceptíveis e escolho aleatoriamente alguns que serão
infectados. Eu posso começar com um infectado, por exemplo.
4. Defino a probabilidade de que um susceptível seja infectado se ele
entrar em contato com um infectado (a uma certa distância pré-definida).
5. Defino probabilidades de um infectado morrer a cada passo ou se
recuperar ou continuar como infectado.
6. Deixo o sistema rodar até atingir 500 iterações.


[image: Evolucao-mortos-Continente.gif]




On Sat, 4 Apr 2020 at 22:27, Alexandre Galvão Patriota <patriota em ime.usp.br>
wrote:

> Prezados,
>
> Segue abaixo a evolução do número de mortos pelo Covid19 desde o primeiro
> morto até o dia de hoje para os seguintes países: Brasil, Alemanha, Itália
> Suécia e Estados Unidos. Notem que o primeiro morto em cada país ocorre em
> datas diferentes.
>
> Brasil no início seguindo de perto a Itália. Notem a explosão do número de
> mortos nos Estados Unidos a partir do vigésimo dia. Aguardemos para saber o
> que acontecerá nas próximas semanas.
>
> [image: Evolucao-mortos.gif]
>
> Att
>
>
>
>
> On Thu, 2 Apr 2020 at 12:15, Alexandre Galvão Patriota <
> patriota em ime.usp.br> wrote:
>
>> Caros,
>>
>> Estou começando a simular alguns cenários em forma de cluster.
>>
>> A infecção se inicia em um cluster inicial, mais denso, em apenas 3
>> pessoas e se espalha por proximidade do infectado com alguém susceptível.
>> Depois de infectado, o individuo tem dois desfechos possíveis: recuperação
>> ou morte.
>>
>> Os resultados dependem bastante da distância mínima para evitar contágio.
>> Segue um exemplo:
>> [image: teste2.gif]
>> Abraços.
>>
>>
>> On Fri, 27 Mar 2020 at 19:46, Alexandre Galvão Patriota <
>> patriota em ime.usp.br> wrote:
>>
>>> Prezados,
>>>
>>> Recomendo os videos abaixo para aqueles que estão tentando modelar
>>> epidemias:
>>>
>>> https://www.youtube.com/watch?v=gxAaO2rsdIs&feature=youtu.be
>>>
>>> https://www.youtube.com/watch?v=MZ957qhzcjI
>>>
>>>
>>> Att
>>>
>>>
>>> Prof. Dr. Alexandre G. Patriota,
>>> Department of Statistics,
>>> Institute of Mathematics and Statistics,
>>> University of São Paulo, Brazil.
>>>
>>
>>
>> --
>> Prof. Dr. Alexandre G. Patriota,
>> Department of Statistics,
>> Institute of Mathematics and Statistics,
>> University of São Paulo, Brazil.
>>
>
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> --
> Prof. Dr. Alexandre G. Patriota,
> Department of Statistics,
> Institute of Mathematics and Statistics,
> University of São Paulo, Brazil.
>


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Prof. Dr. Alexandre G. Patriota,
Department of Statistics,
Institute of Mathematics and Statistics,
University of São Paulo, Brazil.
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